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- ゲノム大規模解析システム 一式
入札情報
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案件公示書
- 案件概要
調達に必要とされる基本的な要求要件 ゲノム大規模解析システムは、次世代DNAシークエンサーとデータ解析サーバから構成される。シロイヌナズナ等モデル植物のゲノムDNA配列解析、ChIP-seq (クロマチン免疫沈降配列解析)、RNA-seq(網羅的遺伝子発現解析)、マルチプレックス法によるDNA配列解析を行うことを目的とする。本システムは基礎生物学研究所・生物機能解析センター(共通棟I)に設置する。本装置の要求要件は次の6項目である。 次世代DNAシークエンサーについて: A 各DNA断片あたり100塩基を98%以上の正確性で読み取れ、片側または両側からの読み取り方式を選択できること。 B 8レーンのフローセルが2枚までセットでき、8日で150G塩基以上の読み取り容量と速度を持つこと C DNAの読み取りは、固相式試料増幅装置で増幅しフローセルに固定化したDNA断片を鋳型に4色の蛍光で逐次的に標識された反応生成物をレーザーで走査する方式であること。 D フローセル上にDNA断片の増幅と固定化を自動的に行う装置を付随すること。 データ解析サーバについて: E CPU性能が、Dell社製R610Sever(8CPU、48G RAM)×3ユニット相当以上であること。 F ストレージ性能が、Isilon 社製I Q12000 Storageモジュール×3ユニット相当以上であること。 本調達には機器の据付、調整一式も含まれる。
- 案件備考
機関名:自然科学研究機構
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- 履行場所
説明会日
2010.08.30資料交付日
2010.09.24資料等提出日
2010.09.24入札日
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