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- ゲノム大規模解析システム 一式
入札情報
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案件公示書
- 案件概要
ゲノム大規模解析システムは、次世代DNAシ ークエンサーとデータ解析サーバから構成さ れる。シロイヌナズナ等モデル植物のゲノム DNA配列解析、ChIP-seq (クロマチン免疫沈降 配列解析)、RNA-seq(網羅的遺伝子発現解析)、 マルチプレックス法によるDNA配列解析を行う ことを目的とする。本システムは基礎生物学 研究所・生物機能解析センター(共通棟I) に設置する。本装置の要求要件は次の6項目 である。 次世代DNAシークエンサーについて: A 各DNA断片あたり100塩基を98%以上の正確 性で読み取れ、片側または両側からの読み 取り方式を選択できること。 B 8レーンのフローセルが2枚までセット でき、8日で150G塩基以上の読み取り容量 と速度を持つこと C DNAの読み取りは、固相式試料増幅装置で 増幅しフローセルに固定化したDNA断片を鋳 型に4色の蛍光で逐次的に標識された反応 生成物をレーザーで走査する方式であるこ と。 D フローセル上にDNA断片の増幅と固定化を 自動的に行う装置を付随すること。 データ解析サーバについて: E CPU性能が、Dell社製R610Sever(8CPU,48 G RAM)×3ユニット相当以上であること。 F ストレージ性能が、Isilon社製IQ12000 Storageモジュール×3ユニット相当以上で あること。 本調達には機器の据付、調整一式も含まれる。
- 案件備考
大学共同利用機関法人自然科学研究機構
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- 履行場所
説明会日
2010.08.30資料交付日
2010.09.24資料等提出日
2010.09.24入札日
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